Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms