Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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