Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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