Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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