Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ARHGEF6Q15052 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms