Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms