Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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