Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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