Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms