Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH18Q13634 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH18Q13634 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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CDH18Q13634 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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CDH18Q13634 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH18Q13634 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CDH18Q13634 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CDH18Q13634 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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CDH18Q13634 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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CDH18Q13634 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH18Q13634 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CDH18Q13634 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
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CDH18Q13634 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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