Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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