Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms