Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms