Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AF279873.2-201ENST00000468681 744 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LYRM4-207ENST00000480566 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 IGHV1-17-201ENST00000520119 334 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC091563.1-201ENST00000520544 490 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC121320.1-201ENST00000580975 839 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AP000962.2-201ENST00000624971 1101 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms