Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBE1Q04446 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms