Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms