Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms