Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms