Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ERVK-16P61578 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVK-16P61578 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVK-16P61578 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVK-16P61578 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVK-16P61578 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVK-16P61578 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVK-16P61578 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVK-16P61578 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ERVK-16P61578 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms