Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms