Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSCP56915 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSCP56915 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms