Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms