Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC4P56524 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms