Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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