Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATMP50440 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms