Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSR1P43307 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSR1P43307 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSR1P43307 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSR1P43307 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSR1P43307 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSR1P43307 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms