Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTHFRP42898 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms