Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCAP28676 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCAP28676 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCAP28676 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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