Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MMP11P24347 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MMP11P24347 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MMP11P24347 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MMP11P24347 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MMP11P24347 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MMP11P24347 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MMP11P24347 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MMP11P24347 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MMP11P24347 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MMP11P24347 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MMP11P24347 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MMP11P24347 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MMP11P24347 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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MMP11P24347 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MMP11P24347 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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