Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPREP23469 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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