Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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