Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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