Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms