Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CSN3P07498 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CSN3P07498 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CSN3P07498 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms