Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG7O95352 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.7 ms