Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DENRO43583 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DENRO43583 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DENRO43583 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms