Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SMAD6O43541 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SMAD6O43541 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SMAD6O43541 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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SMAD6O43541 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SMAD6O43541 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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