Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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