Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
J3QRK9 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
J3QRK9 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
J3QRK9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms