Protein–RNA interactions for Protein: A6NER0

TBC1D3F, TBC1 domain family member 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3FA6NER0 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TBC1D3FA6NER0 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TBC1D3FA6NER0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TBC1D3FA6NER0 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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TBC1D3FA6NER0 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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TBC1D3FA6NER0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TBC1D3FA6NER0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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