Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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