Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms