Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms