Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRPF3Q9ULD4 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms