Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms