Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms