Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms