Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms