Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLRX-201ENST00000237858 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CA5BP1-204ENST00000380336 843 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00114-202ENST00000429621 827 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092669.1-202ENST00000449673 905 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02556-201ENST00000450776 346 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP135-201ENST00000516549 247 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYZL6-201ENST00000615905 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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