Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRXN1-212ENST00000412315 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPRC5D-AS1-202ENST00000499948 1746 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD9B-207ENST00000409778 1373 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 KNG1-203ENST00000447445 1391 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP2R3A-205ENST00000490467 1782 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM118B-201ENST00000360194 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 YTHDF1P1-201ENST00000515217 1646 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC098614.1-202ENST00000634895 1830 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC109347.1-201ENST00000562919 2036 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A7A-201ENST00000329256 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 BSPH1-201ENST00000344839 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSD17B3-202ENST00000375263 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR13D3P-201ENST00000412501 937 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GACAT3-201ENST00000426539 1096 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOP56P1-203ENST00000440030 372 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms